W latach 60. ubiegłego stulecia w Szamotułach istniał szpital sióstr Joanitanek przy placu Sienkiewicza, w budynku obecnego Sądu. Lekarzem powiatowym był wówczas dr Jackiel (Niemiec), a drugim lekarzem był Izraelita dr Munter.
Historia szpitala św. Józefa w Szamotułach rozpoczyna się w roku 1894, kiedy do Siostry Służebniczki Niepokalanego Poczęcia N.M.P. Zgromadzenia Zakonnego z Pleszewic zakupiły od p. Lindnera - inspektora szkolnego w Szamotułach działkę przy ulicy Sukienniczej. Wybudowały Dom Zakonny mniejszy od strony ulicy Poznańskiej, a przy nim większy jako szpital. Budowę ukończono w 1911 roku. W szpitalu pracował dr Sylwester Niziński, potem dr Owsiany i dr Antoni Nowicki. Wybudowano też kostnicę.
W latach 1927 - 1930 dobudowano drugą dużą część szpitala, o bardzo estetycznym wyglądzie zarówno wewnątrz jak i na zewnątrz. Szpital liczył 115 łóżek. Od tego czasu dyrektorem i jedynym chirurgiem w Szamotułach aż do 1939 roku był dr med. Antoni Nowicki. Szpital przyjął nazwę - Szpitala świętego Józefa.
1. września 1939 roku - początek wojny - rodziny odbierały chorych ze szpitala. Pozostało tylko trzydziestu chorych.
7. września 1939 roku wojsko niemieckie wkroczyło do szpitala. Nastąpiła zmiana personelu.
Do szpitala przybywało coraz więcej lekarzy - Niemców. W kaplicy przyszpitalnej Niemcy urządzili laboratorium i Rentgen. Wybudowali pawilon dla zakaźnie chorych, oraz drugi dla personelu, obok szpitala, od strony południowej, z podziemnym przejściem do szpitala.
26 stycznia 1945 roku wkroczyły wojska rosyjskie. Laboratorium i rentgen przeniesiono z kaplicy przyszpitalnej na parter od strony południowo - zachodniej. Obok była apteka szpitalna i małe pomieszczenie dla Ks. Kapelana . Było też biuro szpitalne i pokój lekarski, oraz refektarz Sióstr od strony wschodniej. Jako główny ordynator pracował dr Kociński, a po przyjeździe dr Dullina ustąpił i pracował w pawilonie dla zakaźnie chorych nad rzeką Samą.
3. października 1949 roku do szpitala św. Józefa przybyła komisja z Urzędu Miejskiego i nastąpiło przejęcie szpitala przez PRL. Otrzymał on nową nazwę - Szpital Powiatowy w Szamotułach. Obok apteki, RTG i laboratorium urządzono oddział wewnętrzny, którym opiekował się dr Sitowski. Budowę nowego szpitala rozpoczęto w 1973 roku, a ukończono w 1976 roku. Potem poddano kapitalnemu remontowi stary gmach szpitala. Na uwagę zasługuje równoległa budowa pralni szpitalnej, prosektorium, stacji uzdatniania wody, hotelu pielęgniarskiego oraz budynku administracyjnego.
Zarówno dyrektor Wiktor Dullin jak i jego następca dyrektor Jan Leszek Adamski nie wyrazili zgody na zwalnianie z pracy Sióstr Zakonnych. Ich praca była oceniana bardzo wysoko i większość z nich pracowała aż do emerytury, a niektóre pracowały w dalszym ciągu w niepełnym wymiarze godzin.
Budowa i rozbudowa szpitala zostały zakończone w 1979 - 80 roku i wówczas Szamotuły stanowiły jeden z najlepszych szpitali w województwie. W 1975 roku (tak jak w całym kraju) w Szamotułach utworzono Zespół Opieki Zdrowotnej, którego dyrektorem został dr Jan Leszek Adamski. Po jego rezygnacji w 1979 roku funkcji dyrektora objął dr Roman Handschuh. W kwietniu 1991 roku dyrektorem naczelnym wyłonionym w drodze konkursu został inż. Michał Kudłaszyk, który pełni tą funkcję do chwili obecnej.